Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD23AP54725 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms