Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM4P49221 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms