Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRPPRCP42704 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms