Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5C1P36542 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms