Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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