Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGB2P26583 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGB2P26583 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms