Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPREP23469 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPREP23469 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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