Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USF1P22415 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USF1P22415 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USF1P22415 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USF1P22415 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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