Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNA2P20248 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms