Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATF1P18846 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms