Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOT1P17174 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GOT1P17174 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GOT1P17174 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GOT1P17174 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms