Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRG2P13727 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms