Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUP10909 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUP10909 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUP10909 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms