Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PKHD1P08F94 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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