Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NGFRP08138 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms