Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3BO95985 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms