Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFT2D2O95562 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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