Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms