Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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