Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SETD1AO15047 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms