Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms