Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms