Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX56Q9NY93 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX56Q9NY93 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX56Q9NY93 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX56Q9NY93 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX56Q9NY93 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX56Q9NY93 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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