Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 FKBP8-214ENST00000609656 220 ntTSL 25.99□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 516.58■□□□□ 0.256e-9■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 INF2-208ENST00000481338 1102 ntTSL 216.19■□□□□ 0.186e-9■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 212.77□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 47.91□□□□□ -1.146e-9■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 27.59□□□□□ -1.196e-9■■■■■ 30.2
CSTF2TQ9H0L4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.971e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-205ENST00000477395 762 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-208ENST00000537745 1065 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.791e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-207ENST00000536606 572 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 58.71□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 26.51□□□□□ -1.371e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 RAN-206ENST00000535090 657 ntTSL 55.18□□□□□ -1.581e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 MMP25-AS1-208ENST00000573953 1001 ntTSL 317.68■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.91□□□□□ -1.629e-9■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 ETHE1-202ENST00000594342 702 ntTSL 212.1□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-206ENST00000585855 1170 ntTSL 318.31■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-213ENST00000590436 1149 ntTSL 518.31■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)18.07■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-215ENST00000590684 1313 ntTSL 315.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 FGFRL1-207ENST00000512562 335 ntTSL 414.85□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-214ENST00000590605 541 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 214.39□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 514.14□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF3-209ENST00000586410 288 ntTSL 512.52□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 213.34□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 511.79□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 59.24□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-215ENST00000478463 1489 ntTSL 221.3■■□□□ 13e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-209ENST00000470388 872 ntTSL 516.84■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-216ENST00000482929 1524 ntTSL 216.44■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-219ENST00000492888 872 ntTSL 315.96■□□□□ 0.153e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-208ENST00000469892 889 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-203ENST00000426982 3213 ntTSL 511□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-220ENST00000494948 766 ntTSL 48.75□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0319L-205ENST00000440579 2171 ntTSL 28.61□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 30.1
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 522.76■■□□□ 1.232e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.692e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 217.77■□□□□ 0.442e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 215.78■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 415.01□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-206ENST00000594207 816 ntTSL 511.05□□□□□ -0.648e-8■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 POLR2H-201ENST00000412877 836 ntTSL 220.68■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.843e-8■■■■■ 30
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 316.63■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 415.56■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 48.84□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-209ENST00000596953 1043 ntTSL 220.71■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-202ENST00000593637 1043 ntTSL 320.71■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-210ENST00000597607 1164 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-216ENST00000598987 1202 ntTSL 214.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-225ENST00000601652 551 ntTSL 413.49□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-211ENST00000598298 868 ntTSL 511.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-205ENST00000594807 569 ntTSL 411.47□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-219ENST00000600076 484 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-212ENST00000598333 822 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 TECR-208ENST00000596164 245 ntTSL 37.01□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR1-207ENST00000504739 555 ntTSL 314.55□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 511.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 414.77□□□□□ -0.055e-10■■■■■ 29.9
CSTF2TQ9H0L4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.624e-10■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.454e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.444e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 29.8
CSTF2TQ9H0L4 KCNJ10-202ENST00000509700 870 ntTSL 510.28□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 29.8
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