Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN10Q96LJ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN10Q96LJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBXN10Q96LJ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms