Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM46Q7Z4K8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM46Q7Z4K8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM46Q7Z4K8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms