Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scn9aQ62205 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scn9aQ62205 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scn9aQ62205 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scn9aQ62205 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scn9aQ62205 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scn9aQ62205 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scn9aQ62205 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn9aQ62205 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn9aQ62205 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn9aQ62205 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms