Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4aQ62178 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4aQ62178 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema4aQ62178 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema4aQ62178 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms