Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC38Q5VT99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC38Q5VT99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC38Q5VT99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms