Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcgf5Q3UK78 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcgf5Q3UK78 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcgf5Q3UK78 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms