Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE7AQ13946 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE7AQ13946 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE7AQ13946 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE7AQ13946 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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