Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 ARC35YNR035C 1029 nt6.71□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 HOG1YLR113W 1308 nt6.71□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 NUP84YDL116W 2181 nt6.7□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 MMS21YEL019C 804 nt6.7□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YHR033WYHR033W 1272 nt6.7□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 CPR2YHR057C 618 nt6.7□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 NSE5YML023C 1671 nt6.7□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 UTP6YDR449C 1323 nt6.7□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 CRZ1YNL027W 2037 nt6.69□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 TKL1YPR074C 2043 nt6.69□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt6.69□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YNL194CYNL194C 906 nt6.69□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 AOS1YPR180W 1044 nt6.69□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 ATF1YOR377W 1578 nt6.69□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 PET112YBL080C 1626 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 IMA2YOL157C 1770 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GET2YER083C 858 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 MTR3YGR158C 753 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YIA6YIL006W 1122 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YJL107CYJL107C 1164 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 HAM1YJR069C 594 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GEP5YLR091W 882 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 RSA3YLR221C 663 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 NAT5YOR253W 531 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GEX1YCL073C 1848 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GEX2YKR106W 1848 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GAA1YLR088W 1845 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 RSM23YGL129C 1353 nt6.68□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GSH1YJL101C 2037 nt6.67□□□□□ -1.34 RIP-Chip
NOP56Q12460 BPL1YDL141W 2073 nt6.67□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 MSS1YMR023C 1581 nt6.67□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 CAR2YLR438W 1275 nt6.67□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GPB2YAL056W 2643 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 GPH1YPR160W 2709 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 DIT1YDR403W 1611 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 DST1YGL043W 930 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 TDH1YJL052W 999 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YBL081WYBL081W 1107 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 JIP4YDR475C 2631 nt6.66□□□□□ -1.34 RIP-Chip
NOP56Q12460 CLB4YLR210W 1383 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 XBP1YIL101C 1944 nt6.66□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 ESC8YOL017W 2145 nt6.65□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 FAT3YKL187C 2253 nt6.65□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 PIC2YER053C 903 nt6.65□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YOL079WYOL079W 399 nt6.65□□□□□ -1.34
NOP56Q12460 YMR279CYMR279C 1623 nt6.65□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 PPM1YDR435C 987 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YIL168WYIL168W 384 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YKL147CYKL147C 618 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 IRC11YOR013W 471 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 ADA2YDR448W 1305 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YBR138CYBR138C 1575 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 PAP2YOL115W 1755 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 TAH11YJR046W 1815 nt6.64□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 EMW1YNL313C 2715 nt6.63□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 UTR5YEL035C 501 nt6.63□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 HAS1YMR290C 1518 nt6.63□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 ECM2YBR065C 1095 nt6.63□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 GUS1YGL245W 2127 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 IME2YJL106W 1938 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YGL260WYGL260W 231 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 RHO4YKR055W 876 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 LIP5YOR196C 1245 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YAH1YPL252C 519 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 SCT1YBL011W 2280 nt6.62□□□□□ -1.35 RIP-Chip
NOP56Q12460 IRS4YKR019C 1848 nt6.62□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 GLE1YDL207W 1617 nt6.61□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 GAT1YFL021W 1533 nt6.61□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 TAD2YJL035C 753 nt6.61□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 PHA2YNL316C 1005 nt6.61□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YNR068CYNR068C 819 nt6.61□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 IRC5YFR038W 2562 nt6.61□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 ALT1YLR089C 1779 nt6.6□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.6□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YGL118CYGL118C 438 nt6.6□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 VPS65YLR322W 315 nt6.6□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 SNT309YPR101W 528 nt6.6□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 STE3YKL178C 1413 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 GDH1YOR375C 1365 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YDR215CYDR215C 414 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 YDR476CYDR476C 675 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 CIS3YJL158C 684 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 OPI8YKR035C 642 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 RIB1YBL033C 1038 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 CPA1YOR303W 1236 nt6.59□□□□□ -1.35
NOP56Q12460 DEF1YKL054C 2217 nt6.59□□□□□ -1.35 RIP-Chip
NOP56Q12460 PGI1YBR196C 1665 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 MHP1YJL042W 4197 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 YGR291CYGR291C 222 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 CPT1YNL130C 1182 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 ATG18YFR021W 1503 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 RSC2YLR357W 2670 nt6.58□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 ELP4YPL101W 1371 nt6.57□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 GPT2YKR067W 2232 nt6.57□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 ERG24YNL280C 1317 nt6.57□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 GPI18YBR004C 1302 nt6.57□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 SPR1YOR190W 1338 nt6.57□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 WHI4YDL224C 1950 nt6.57□□□□□ -1.36
NOP56Q12460 MRP1YDR347W 966 nt6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.9 ms