Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGEF1BQ0VAM2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms