Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BDH1Q02338 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BDH1Q02338 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BDH1Q02338 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms