Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME3P61289 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME3P61289 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME3P61289 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME3P61289 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSME3P61289 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME3P61289 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME3P61289 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSME3P61289 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME3P61289 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSME3P61289 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSME3P61289 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME3P61289 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME3P61289 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME3P61289 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME3P61289 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME3P61289 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME3P61289 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME3P61289 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSME3P61289 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME3P61289 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME3P61289 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME3P61289 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME3P61289 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME3P61289 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME3P61289 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME3P61289 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME3P61289 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME3P61289 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME3P61289 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME3P61289 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME3P61289 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME3P61289 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME3P61289 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME3P61289 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME3P61289 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME3P61289 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME3P61289 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms