Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1BP61266 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1BP61266 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1BP61266 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1BP61266 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1BP61266 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1BP61266 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1BP61266 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX1BP61266 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX1BP61266 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1BP61266 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1BP61266 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX1BP61266 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STX1BP61266 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1BP61266 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1BP61266 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX1BP61266 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX1BP61266 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX1BP61266 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1BP61266 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1BP61266 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1BP61266 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1BP61266 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1BP61266 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1BP61266 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1BP61266 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1BP61266 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1BP61266 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1BP61266 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1BP61266 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1BP61266 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1BP61266 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1BP61266 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1BP61266 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1BP61266 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1BP61266 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1BP61266 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1BP61266 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1BP61266 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1BP61266 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1BP61266 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1BP61266 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX1BP61266 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1BP61266 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1BP61266 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1BP61266 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1BP61266 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX1BP61266 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms