Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A1P43005 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A1P43005 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC1A1P43005 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms