Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Aco1P28271 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Aco1P28271 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aco1P28271 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Aco1P28271 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aco1P28271 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aco1P28271 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Aco1P28271 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aco1P28271 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aco1P28271 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aco1P28271 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms