Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUTAO60888 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUTAO60888 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUTAO60888 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUTAO60888 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUTAO60888 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUTAO60888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUTAO60888 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUTAO60888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUTAO60888 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUTAO60888 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUTAO60888 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUTAO60888 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUTAO60888 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUTAO60888 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUTAO60888 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUTAO60888 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CUTAO60888 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUTAO60888 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUTAO60888 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CUTAO60888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CUTAO60888 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUTAO60888 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUTAO60888 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUTAO60888 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUTAO60888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUTAO60888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUTAO60888 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUTAO60888 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUTAO60888 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUTAO60888 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUTAO60888 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUTAO60888 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUTAO60888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUTAO60888 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUTAO60888 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUTAO60888 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUTAO60888 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUTAO60888 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CUTAO60888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUTAO60888 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUTAO60888 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUTAO60888 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUTAO60888 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUTAO60888 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUTAO60888 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUTAO60888 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUTAO60888 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUTAO60888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CUTAO60888 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CUTAO60888 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CUTAO60888 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CUTAO60888 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUTAO60888 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUTAO60888 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUTAO60888 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUTAO60888 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CUTAO60888 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms