Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Eif6O55135 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eif6O55135 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Eif6O55135 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Eif6O55135 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Eif6O55135 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Eif6O55135 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Eif6O55135 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Eif6O55135 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif6O55135 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif6O55135 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Eif6O55135 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif6O55135 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Eif6O55135 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms