Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHOX2AO14813 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PHOX2AO14813 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHOX2AO14813 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHOX2AO14813 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms