Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cspp1B2RX88 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cspp1B2RX88 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cspp1B2RX88 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cspp1B2RX88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms