Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDR42E2A6NKP2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDR42E2A6NKP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDR42E2A6NKP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms