Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRE8

Zscan4e, Zinc finger and SCAN domain-containing 4E, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4eA0A1B0GRE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4eA0A1B0GRE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4eA0A1B0GRE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4eA0A1B0GRE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zscan4eA0A1B0GRE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms