Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00312Q9Y6C7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms