Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCE1Q9Y256 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms