Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms