Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPATCH8Q9UKJ3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms