Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPB1Q9UBR1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UPB1Q9UBR1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms