Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEPPQ9NTK1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEPPQ9NTK1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms